Σοβαρό θέμα με τους χειρισμούς του ΥΠΕΞ Νίκου Κοτζιά σε σειρά θεμάτων της εξωτερικής πολιτικής, αλλά και για την γενικότερη συμπεριφορά του έχει ανακύψει για τον ΣΥΡΙΖΑ . Πέρα από κατά καιρούς επικρίσεις που έχουν διατυπωθεί , σποραδικά στα κομματικά όργανα για τον υπουργό Εξωτερικών για την εθνικιστική του ρητορική στο Κυπριακό και το θέμα της ΠΓΔΜ, ο Κοτζιάς κατηγορείται έντονα από υψηλόβαθμα κομματικά στελέχη ότι , με την ανοχή του Αλέξη Τσίπρα έως τώρα, έχει πετύχει να ασκεί δική του εξωτερική πολιτική και να έχει υψώσει στεγανά στο ΥΠΕΞ.

Στον ΣΥΡΙΖΑ δεν ξεχνούν ότι ο Κοτζιάς καλούσε την Χρυσή Αυγή στις συσκέψεις του ΕΣΕΠ και αναγκάστηκε να την αποκλείσει όταν ο Μιχαλολιάκος αποκάλυψε έγγραφο του ΥΠΕΞ με το οποίο ζητούσε από τους αρχηγούς των κομμάτων προτάσεις για την ονομασία της ΠΓΔΜ. Θέμα που δεν ήταν δική του αρμοδιότητα αλλά των αρχηγών των κομμάτων.
Την περασμένη Τρίτη 29 Αυγούστου, τα θέματα αυτά τέθηκαν στην συνεδρίαση του Εκτελεστικού Συμβουλίου του ΣΥΡΙΖΑ. Σύμφωνα με κομματικές πηγές, το αμέσως επόμενο διάστημα αναμένεται να οξυνθεί , ίσως και δημόσια η κριτική στον υπουργό Εξωτερικών, ενώ ταυτόχρονα εκφράστηκαν έντονες ανησυχίες για την στάση του στο θέμα των Σκοπίων, καθώς επίκεινται νέες διαπραγματεύσεις. Το γεγονός, τονίζουν οι ίδιες πηγές, ότι ο κ. Κοτζιάς αποφεύγει να πάρει θέση στο θέμα της ονομασίας της ΠΓΔΜ και υπέρ της σύνθετης ονομασίας προφανώς για να κάνει το δικό του «πατριωτικό σόου», εγείρει σοβαρό πολιτικό ζήτημα. Επειδή όμως γνωρίζουν στον ΣΥΡΙΖΑ ότι ο Κοτζιάς μπορεί να αλλάξει θέση και άποψη πολλές την ίδια ημέρα, εκτιμούν ότι πιθανόν να αναμένει τη νέα πρωτοβουλία  για το όνομα και ανάλογα με το κλίμα που θα διαμορφωθεί , αρνητικό ή θετικό , να πάρει και εκείνος θέση. Εκτός και αν δεχθεί πιέσεις, οπότε υπό το κράτος πανικού να αναγκαστεί να τοποθετηθεί.
Το θέμα είναι, σύμφωνα με υψηλόβαθμη κομματική πηγή, ότι η  κραυγαλέα φιλοισραηλινή πολιτική του Κοτζιά ακόμη και στο παλαιστινιακό, η έντονα εθνικιστική ρητορική στο Κυπριακό, η αποτυχία του να πείσει το ΝΑΤΟ να μην δεχθεί τους όρους της Τουρκίας στο Αιγαίο που αποκαλεί τα ελληνικά νησιά με κωδικούς και όχι με τα ονόματά τους και πολλά ακόμη προκαλούν πλέον αντιδράσεις. Κριτική δέχεται και ο πρωθυπουργός που  έχει περιοριστεί σε δευτερεύοντα ρόλο.
Αν τα στελέχη αυτά πείσουν τον πρωθυπουργό να αντικαταστήσει τον Κοτζιά κατά τον ανασχηματισμό, είναι άλλη υπόθεση που ήδη συζητείται στο παρασκήνιο. Το  όλο ζήτημα πάντως θα μας απασχολήσει έντονα και σύντομα μάλιστα.