Η διόγκωση του μεταναστευτικού και μεταναστευτικού προβλήματος και η ανάγκη αποτελεσματικής διαχείρισής του οδήγησε τον πρωθυπουργό στην δημιουργία ενός ακόμη κυβερνητικού οργάνου, του Κυβερνητικού Συμβουλίου για την Προσφυγική και Μεταναστευτική Πολιτική.  Η απόφαση του υπουργικού συμβουλίου ελήφθη το Σάββατο 19 Μαρτίου με σχεδόν κατεπείγουσα διαδικασία μετά από σύσκεψη κυβερνητικών παραγόντων υπό τον κ. Τσίπρα με θέμα  την εφαρμογή της συμφωνίας της Ευρωπαϊκής Ένωσης με την Τουρκία. 

Το Κυβερνητικό Συμβούλιο για την Προσφυγική και Μεταναστευτική Πολιτική,  θα έχει ως στόχο το συντονισμό για την εφαρμογή της προσφυγικής και μεταναστευτικής πολιτικής, τη λήψη ενδεχόμενων μέτρων νομοθετικής πρωτοβουλίας, την παρακολούθηση και το συντονισμό της εφαρμογής των αποφάσεων και τη λήψη αποφάσεων για τη συγκρότηση επιχειρησιακών και επιτελικών ομάδων για την υλοποίηση της συμφωνίας. Πρόκειται δηλαδή για εργασία που θα μπορούσε άνετα να ανταποκριθεί το υπουργείο μεταναστευτικής πολιτικής. Ήδη εκτός από το υπουργείο λειτουργεί και το Συντονιστικό Όργανο και τώρα προστίθεται και το Κυβερνητικό Συμβούλιο. Προφανώς για προσδώσει περισσότερη βαρύτητα στο Συμβούλιο , ώστε να φαντάζει ως Συμβούλιο Εθνικής Ασφάλειας, θα μετέχουν χωρίς δικαίωμα ψήφου ο αρχηγός του Γενικού Επιτελείου Εθνικής Άμυνας, ο αρχηγός της Ελληνικής Αστυνομίας, ο αρχηγός του Λιμενικού Σώματος και ο γενικός γραμματέας της κυβέρνησης, και όσα άλλα μέλη της κυβέρνησης ή υφυπουργοί καλούνται κάθε φορά από τον πρωθυπουργό. Μπορεί, επίσης, να καλούνται για παροχή γνώμης στελέχη της δημόσιας διοίκησης. Yπενθυμίζεται ότι υπάρχουν ήδη  και λειτουργούν το Κυβερνητικό Συμβούλιο Οικονομικής Πολιτικής, το Κυβερνητικό Συμβούλιο Κοινωνικής Πολιτικής, φυσικά και το υπουργικό συμβούλιο . Η δημιουργία όλων αυτών των δομών ενώ φαντάζει ως επιλογή που καταδεικνύει το αυξημένο ενδιαφέρον της κυβέρνησης, εν τούτοις προκαλεί σκεπτικισμό γιατί η πληθώρα κυβερνητικών οργάνων μάλλον αποδυναμώνει την κεντρική ευθύνη του υπουργικού συμβουλίου. Θα αρκούσε ένα Συμβούλιο Εθνικής Ασφάλειας που να αντιμετωπίζει κρίσιμες καταστάσεις και τίποτα παραπάνω. Πρόεδρος του Συμβουλίου θα είναι ο πρωθυπουργός, ενώ σε αυτό θα συμμετέχουν ως μέλη ο υπουργός Εθνικής Άμυνας, ο υπουργός Εξωτερικών, ο υπουργός Δικαιοσύνης, Διαφάνειας και Ανθρωπίνων Δικαιωμάτων, ο υπουργός Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής, ο υπουργός Επικρατείας (αρμόδιος για το Συντονισμό του κυβερνητικού έργου), ο αναπληρωτής υπουργός Εσωτερικών και Διοικητικής Ανασυγκρότησης (αρμόδιος για θέματα Προστασίας του Πολίτη), ο αναπληρωτής υπουργός Εσωτερικών και Διοικητικής Ανασυγκρότησης (αρμόδιος για θέματα Μεταναστευτικής Πολιτικής), ο αναπληρωτής υπουργός Εθνικής Άμυνας, ο αναπληρωτής Υπουργός Εξωτερικών, ο αναπληρωτής υπουργός Οικονομικών (αρμόδιος για τη Γενική Γραμματεία Δημοσιονομικής Πολιτικής) και ο υφυπουργός Οικονομίας, Ανάπτυξης και Τουρισμού .